这篇教程Ubuntu+python将nii图像保存成png格式写得很实用，希望能帮到您。
系统：Ubuntu 16.04
软件： python 3.5
先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。
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import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
def read_niifile(niifile):
img = nib.load(niifile)
img_fdata = img.get_fdata()
return img_fdata
def save_fig(file):
fdata = read_niifile(file)
(x,y,z) = fdata.shape
for k in range(z):
silce = fdata[k,:,:]
imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
dir = './.nii'
savepicdir = ''
os.mkdir(savepicdir)
save_fig(dir)
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不要忘记返回img_fdata，否则下一个文件会报错。
python nii图像扩充
python实现批量nii文件转换为png图像 |
